El polen recuperado de los sedimentos de la cueva de Guila Naquitz, Oaxaca, se compara con el polen que representa patrones ecológicos modernos en el Valle de Oaxaca. Esto permite la reconstrucción de los patrones climáticos y de vegetación de la cabaña para el período de ocupación precerámica de la cueva: aproximadamente, 6000-8000 a.C. Aparentemente prevaleció un clima generalmente más frío, pero más xérico, como lo habían sugerido los análisis de fauna en la cueva de Coxcatlán cerca de Tehuacán, Puebla. Sin embargo, los recursos de flora y fauna disponibles cerca de la cueva en la actualidad estaban disponibles en el momento de la ocupación. El polen que representa una planta que está estrechamente relacionada con el maíz moderno es reconocible a partir del registro de polen. La distribución de este polen entre las muestras, así como los restos macrofósiles asociados al polen y el patrón ecológico reconstruido, indican que se estaba cultivando la planta similar al maíz.