El Río Virú tiene su origen en la provincia de Santiago de Chuco en las lagunas Usgón, Brava y Negra ubicadas al pie del cerro Pelón Chico, las cuales dan origen al río Huacapongo y de otro lado las precipitaciones estacionales que caen en los cerros Los Colorados y Guitarras y que dan origen al río Salinas que se une con el Carabamba. Ambos ríos confluyen en las cercanías de la hacienda Tomaval, dando su origen al río Virú. Ya en el siglo XVIII el corregidor Miguel Feijoó se ocupó de la naciente de este río anotando que tenía un recorrido de 18 leguas desde su origen en las alturas afirmando que "tiene su principio de unos cerros llamados Pedernales, al que se le agrega un riachuelo del cerro nombrado Izquiodca; como también otros arroyos y vertientes que corren por la estancias de Carabamba, Uningambak, y Zangual , sitios en dicha provincia".